中国科学院新疆理化技术研究所（以下简称新疆理化所），于2002年3月28日，在原中国科学院新疆物理研究所和新疆化学研究所（均于1961年成立）的基础上整合成立。
　　新疆理化所定位：紧紧围绕着国家、新疆战略需求，坚持以科技创新为中心，以提高关键技术创新和系统集成能力为主线，以对新疆社会和经济发展做出有显示度的贡献为目标。战略发展目标：围绕新疆特色资源的深度开发，结合新疆的地域优势和多语言文化特色，注重科技创新性与新疆经济发展的战略需求相结合，开展干旱区植物资源化学、多语种信息技术、清洁能源与环境治理、新型材料研发、油田化学与矿产资源综合利用等领域战略性、前瞻性高技术研究；在涉及国家安全领域，开展了辐射物理和特种敏感材料的研究。将研究所建设成为中国科学院服务新疆的“桥头堡”和技术创新、集成、转移的基地，建设成为西部乃至中亚一流的高技术研究所。
　　新疆理化所现设有资源化学、材料物理与化学、多语种信息技术、环境科学与技术4个研究室。建设了特种热、压敏研发平台、维吾尔药活性筛选技术平台、辐射效应评估技术平台、多语种软件测试平台、光电功能材料研发平台、药用植物组培与生物育种等科技平台，以及大型仪器分析测试中心、辐照中心、信息情报中心3个技术支撑平台。  
　　研究所现有“中国科学院干旱区植物资源化学重点实验室”，“中国科学院特殊环境功能材料与器件重点实验室”，“民族药关键技术及工艺国家地方联合工程研究中心”，省部共建“新疆特有药用资源利用国家重点实验室培育基地”以及“新疆植物资源化学重点实验室”、“新疆电子信息材料与器件重点实验室”、“民族语音语言信息处理实验室”3个省级重点实验室和新疆精细化工工程技术中心；与中亚地区及我国东部有关研究机构共建了“中亚地区可食植物功能成分联合实验室”；与新疆公安消防总队成立了“火灾科学与消防工程合作实验室”。  
　　截至2014年底，新疆理化所共有在职职工240人。其中科技人员207人、科技支撑人员33人。包括研究员及正高级工程技术人员40人、副研究员及高级工程技术人员74人。共有“青年千人计划”入选者14人（新增10人）；中国科学院“百人计划”入选者14人，“西部之光”人才入选者131人（新增14人）；国家杰出青年科学基金获得者2人（新增1人），国家级“新世纪百千万人才工程”候选人2名（新增1人）。